"Ecdysozoa Üstşubesi İçin Yeni Bir Moleküler Sinapomorfi: Olası Bir Mitogenomik Transkripsiyon Sinyal Dizisinin Deneysel Olarak Araştırılması" adlı 117Z020 numaralı TÜBİTAK projesi kapsamında bilim insanı yetiştirme ve geliştirme projesi
Proje Ekibi (1)
| Proje Türü | Yükseköğretim Kurumları Tarafından Destekli Bilimsel Araştırma Projesi |
| Proje No | - |
| Proje Durumu | Tamamlandı |
| Başlangıç Tarihi | 03-04-2018 |
| Bitiş Tarihi | 14-04-2021 |
| Proje Konusu | "Ecdysozoa Üstşubesi İçin Yeni Bir Moleküler Sinapomorfi: Olası Bir Mitogenomik Transkripsiyon Sinyal Dizisinin Deneysel Olarak Araştırılması" adlı 117Z020 numaralı TÜBİTAK 1001 araştırma projesi kapsamında mitokondriyal transkripsiyon sisteminde görevli proteinlerin klonlanması ve önerilen 'WHWGHTW' sinyal dizisi ile etkileşimi araştırılacaktır. İlkin bulgular ve biyoinformatik veriler ışığında mitokondriyal transkripsiyon sonlanma faktörlerinin oldukça küçük ve post-translasyonel olarak modifiye olmadığı bilinmektedir. Fakat proje kapsamında örnekleme dâhil edilen, oldukça geniş taksonomik çeşitlilik içeren, Ecdysozoa üstşubesine dahil 10 türün olası bir post-translasyonel modifikasyona maruz kalıp kalmadığı bilinmemektedir. Bu durumda nükleik asit- protein etkileşimi gözlenemezse sebebinin etkileşimin olmadığı mı, yoksa proteinin doğru uzaysal konformasyonunda elde edilememesi mi olduğu bilinmeyecektir. Ayrıca etkileşimin yalnızca transkripsiyon sonlanma faktörlerinde sınanması da olası bir etkileşim saptanmaması durumunda transkripsiyon başlama ve transkripsiyon devamlılığında görevli proteinlerin de sınanması ihtiyacını doğuracaktır. Bu da, yeni proteinler için olası post-translasyonel modifikasyonların da değerlendirilmesini gerektirecektir. Bu kapsamda, mitokondriyal transkripsiyon faktörleri, en olası etkileşim sergileyenden başlanarak klonlama aşaması sonrası böcek hücre hatlarına aktarılacaktır. Sonrasında Baculovirüs veya Celfectin reajanları yardımıyla proteinin doğru konformasyona sahip formu çok sayıda elde edilecektir ve sonrasında protein izolasyonu aşamasına devam edilecektir. Bu nedenle, 117Z020 numaralı TÜBİTAK araştırma projesinin bu kapsamda tamamlanmasına ihtiyaç duyulmaktadır. |