Molecular Determination of the Presence of Some Grapevine Viruses and Phylogenetic analyses of Grapevine Virus A in Tokat Province Grapevine Area
Yazarlar (2)
Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Türkiye
Doç. Dr. Şerife TOPKAYA
Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Türkiye
| Makale Türü |
Özgün Makale
|
| Makale Alt Türü | ESCI dergilerinde yayınlanan tam makale |
| Dergi Adı | Journal of Tekirdag Agricultural Faculty |
| Dergi ISSN | 1302-7050 Wos Dergi Scopus Dergi |
| Dergi Tarandığı Indeksler | TR DİZİN, Emerging Sources Citation Index (ESCI) |
| Makale Dili | İngilizce |
| Basım Tarihi | 09-2023 |
| Cilt No | 20 |
| Sayı | 3 |
| Sayfalar | 574 / 585 |
| DOI Numarası | 10.33462/jotaf.1124089 |
| Makale Linki | https://dergipark.org.tr/tr/pub/jotaf/issue/79820/1124089 |
| Özet |
| Türkiye bağcılığı sosyoekonomik anlamda en önemli ürün gruplarının biridir. Bağlarda birçok zararlı organizma grubu özellikle de virüs enfeksiyonları bitkiyi zayıflatıp, verim ve kalitesinde azalmalara yol açtığından karantina ve sertifikasyonda başı çekmektedir. Bu çalışma, bağcılığın çok önemli olduğu Tokat ilinde üretilen asmalarda verim kaybına neden olan bazı viral etmenleri tespit etmek amacıyla yapılmıştır. Tokat Merkez ve ilçelerindeki bazı bağ alanlarından virüs semptomu gösteren asmaların genç yapraklarından ve bir yaşındaki sürgünlerinden örnekler alınmıştır. Toplanan 189 asma örneğine Grapevine pinot gris virus (GPGV), Grapevine virus A (GVA) ve Strawberry latent ringspot virus (SLRSV) varlığını tespit etmek için virüse özgü primerler kullanılarak moleküler bir yöntem olan RT-PCR testine tabi tutulmuştur. Toplam 189 asma örneğinden 80 (%42.32) GVA, 3 (%1.58) GPGV enfeksiyonu tespit edilmiş ve hiçbir örnekte SLRSV (%0) tespit edilmemiştir. Test edilen 189 asma örneğinin 2'sinde (%1.05) birden fazla virüs tespit edilmiştir. Tokat Merkez ve ilçelerinden toplanan bitki örneklerinde en sık görülen virüsün GVA, en az tespit edilen virüsün ise GPGV olduğu belirlenmiştir. GVA ile enfekteli izolatların RT-PCR ürünlerin çift yönlü sekans analizi analizleri yapılmış ve MEGAX bilgisayar programı ile hizalandıktan sonra referans izolatlarla karşılaştırılarak filogenetik analizleri yapılmıştır. Filogenetik analiz çalışmalarına göre, GVA, GenBank'ta kayıtlı izolatlarla ve farklı çalışmada elde edilen izolatlarla farklı dallanma göstermiştir. GVA ile enfekte izolatlar referans izolatlarla %92-94 oranında benzerlik göstermiştir. Bu çalışmada Türk GVA izolatlarının moleküler analizi yapılmıştır. Bu moleküler bilgilerin ileride yapılacak çalışmalara ışık tutacağı öngörülmektedir. |
| Anahtar Kelimeler |
| Filogenetik analiz | Grapevine virus A | Strawberry latent ringspot virus | Grapevine pinot gris virus | Tokat | Vitis vinifera | RT-PCR |
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
| Atıf Sayıları | |
| WoS | 3 |
| SCOPUS | 2 |
| TRDizin | 1 |
| Google Scholar | 3 |