Molecular Determination of Some Important Viruses Causing Infection in Potato Fields in Turkey
Yazarlar (2)
Doç. Dr. Şerife TOPKAYA
Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Türkiye
| Makale Türü |
Özgün Makale
|
| Makale Alt Türü | Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale |
| Dergi Adı | Gaziosmanpaşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi |
| Dergi ISSN | 1300-2910 |
| Dergi Tarandığı Indeksler | TR DİZİN |
| Makale Dili | İngilizce |
| Basım Tarihi | 01-2023 |
| Cilt No | 40 |
| Sayı | 1 |
| Sayfalar | 26 / 32 |
| DOI Numarası | 10.55507/gopzfd.1214396 |
| Makale Linki | https://dergipark.org.tr/tr/pub/gopzfd |
| Özet |
| Patates, dünyada en önemli tarımsal ürünler arasında yer alır ve doğal koşullarda 40’dan fazla virüs türüne hasssas bir bitki türüdür. Bu araştırmada, Afyon, Nevşehir ve Bolu illerindeki patates tarlalarından 2020 yılında toplanan 298 yaprak örneği, bölgede patates üretimini etkileyen virüslerin tespiti için kullanılmıştır. Virüs simptomu (mozaik, şekil bozukluğu, sararma, yapraklarda kıvrılma) gösteren patates bitkilerinin yaprakları, Potato leafroll virus (PLRV), Potato virus A (PVA), Potato virus X (PVX) ve Potato virus M (PVM)’nin varlığını tespit etmek amacıyla, virüs-spesifik primerler kullanılarak RT-PCR testine tabi tutulmuştur. Test edilen 298 tane yaprak örneğinin 46’sınde (%15.43), bir veya birden fazla virüs tespit edilmiştir. Çalışma sonucunda, test edilen örneklerin 43’si PLRV (%14.42), 3’ü PVX (%1) ile enfekteli bulunmuştur. Afyon, Nevşehir ve Bolu illerinden toplanan bitki örneklerinde en yaygın görülen virüsün PLRV, ardından PVX olduğu belirlendi. Örneklerde PVA ve PVM tespit edilmedi. PLRV ile enfekteli olan bazı pozitif izolatların elde edilen sekans verilerinin GenBank’a kayıtlı izolatlarla karşılaştırılması yapılarak filogenetik ilişkileri belirlenmiştir. Filogenetik analize göre, Türkiye PLRV izolatları Sırbistan, Kanada ve Pakistan izolatları ile birlikte Grup 2'de kümelenmiştir. Sonuç olarak, bu çalışmada sadece 5 PLRV izolatı ile çalışılmıştır. İleryen çalışmalarda daha fazla sayıda izolat ile ve diğer protein bölgeleri ile çalışmalar yapılması planlanmaktadır. PVX ile elde edilen RT-PCR ürünleri RT-PCR'da iyi sonuç vermemiş olup, ileride farklı primerler ile çalışılması planlanmaktadır. |
| Anahtar Kelimeler |
| PVA | PVM | PVX | PLRV | RT-PCR |
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
| Atıf Sayıları | |
| Google Scholar | 2 |