Prevalence and molecular characterization of Tomato spotted wilt virus in pepper fields in Tokat province
  
Yazarlar (1)
Doç. Dr. Şerife TOPKAYA Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Türkiye
Makale Türü Açık Erişim Özgün Makale (Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale)
Dergi Adı Bitki Koruma Bülteni
Dergi ISSN 0406-3597 Scopus Dergi
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili İngilizce Basım Tarihi 06-2021
Cilt / Sayı / Sayfa 61 / 3 / 25–35 DOI 10.16955/bitkorb.898371
Makale Linki https://dergipark.org.tr/tr/pub/bitkorb/issue/65139/898371
Özet
Çalışma kapsamında 2016 yılı yaz döneminde biber yetiştirilen Tokat ili Merkez, Niksar, Erbaa ve Pazar ilçelerine sürveyler düzenlenmiş ve virüs şüphesi gösteren biber bitkilerinden yaprak örneği toplanmıştır. Sürvey çalışmaları sonucunda toplanan 324 adet bitki yaprak örneği Tomato spotted wilt virus (TSWV)’e spesifik antiserum ile DAS-ELISA testine tabii tutulduktan sonra virüse spesifik primerlerle RT-PCR işlemi gerçekleştirilmiştir. Testlenen örneklerin %13’nün TSWV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. ELISA testinde pozitif çıkan örnekler S segmentinde yer alan Nucleocapsid proteine (Np) spesifik primerlerle RT-PCR işlemine tabi tutulmuş ve pozitif bant elde edilen örneklerden 3’ü sekans analizine gönderilmiştir. Analiz sonuçlarına göre Türkiye TSWV izolatlarının Np gen bölgesi Fransa ve Güney Kore izolatları ile %98-99 nükleotid benzerliği göstermiştir ve filogenetik ağaçta aynı grupta kümelenmiştir.
Anahtar Kelimeler