Genetic variability of Grapevine Leafroll-Associated Virus-1,2,3,4 Infecting Vineyards in Tokat Province of Turkey      
Yazarlar (2)
Kübra Sarıtaş
Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Türkiye
Doç. Dr. Şerife TOPKAYA Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Türkiye
Makale Türü Açık Erişim Özgün Makale
Makale Alt Türü Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale
Dergi Adı Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi
Dergi ISSN 2149-8245
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili İngilizce
Basım Tarihi 11-2021
Cilt No 7
Sayı 3
Sayfalar 438 / 446
DOI Numarası 10.24180/ijaws.977439
Makale Linki https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/1903590
Özet
Asma yaprak kıvırcıklığı hastalığı (GLRD), dünya çapında asmanın en önemli viral hastalıklarından biridir. Bu çalışma, Grapevine leafroll associated virus -1 (GLRaV-1), Grapevine leafroll associated virus -2 (GLRaV-2), Grapevine leafroll associated virus -3 (GLRaV-3), Grapevine leafroll-associated virus 4 (GLRaV-4), ve Grapevine leafroll-associated virus-9 (GLRaV-9) etmenlerinin yaygınlığının araştırılması amacıyla yapılmıştır. Bunun için Tokat ili Merkez, Erbaa, Niksar ve Pazar ilçelerindeki farklı bağ alanlarından virüs benzeri belirti gösteren asmalardan yaprak örnekleri ve bir yıllık bitki sürgünleri toplanmıştır. Surveyde elde edilen toplam 197 örnek GLRaV-1, GLRaV-2, GLRaV-3, GLRaV-4) ve GLRaV-9 etmenlerine özgü primerler ile iki aşamalı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullanılarak moleküler olarak test edilmiştir. 197 örnekten 106'sı (%53.80) bu virüslerle tekli veya çoklu enfeksiyon tespit edilmiştir. 103 (%52,28) örnek GLRaV-1 ile pozitif sonuçlanırken, enfeksiyon oranları 10 örnekle GLRaV-3 için %5,18, GLRaV-4 için 5 örnekle %2,53, GLRaV-2ve GLRaV-9 için %1,03 olarak belirlenmiştir. GLRaV-1, GLRaV-2 ve GLRaV-3'ün pozitif PCR ürünleri çift yönlü sekans analizinden sonra MEGAX ile GenBank'taki referans diğer izolatlarla karşılaştırılması yapılmıştır. GLRaV-1 izolatlarının sekans analizine göre GenBank'taki referans izolatlarla %94-96, GLRaV-2 izolatları %96-99 ve GLRaV-3'ün UO3-3 izolatı %99-100 nükleotid benzerliği göstermiştir.
Anahtar Kelimeler
Vitis vinifera