Kabak sarı mozaik virüsü izolatlarının kodladığı genlerin diziliminin belirlenmesi ve moleküler karakterizasyonu
Yazarlar (1)
| Makale Türü | Özgün Makale (Uluslararası alan indekslerindeki dergilerde yayınlanan tam makale) | ||
| Dergi Adı | |||
| Makale Dili | – | Basım Tarihi | 01-2015 |
| Makale Linki | https://dspace.ankara.edu.tr/items/d3577dcb-8cab-42a9-87ed-4cc667fd3806 | ||
| UAK Araştırma Alanları |
Fitopatoloji
|
||
| Özet |
| Bu çalışma, kabakgil alanlarında problem olan kabak sarı mozaik virüsü (Zucchini yelllow mosaic virus–ZYMV) izolatlarının kodladığı genlerin dizilimlerinin belirlenmesi amacı ile yapılmıştır. Bu doğrultuda Ankara, Antalya, Burdur illerinden alınan enfekteli kabakgil bitkileri Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Watermelon mosaic virus (WMV), Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV), Papaya ringspot virus-W (PRSV-W) ve Squash mosaic virus (SqMV) antiserumları ile DAS-ELISA testine tabi tutulmuştur. Test sonuçlarına göre 233 örneğin 86’sının (% 36, 9) ZYMV, 116’sının (% 49, 7) WMV, 36’sının (15, 4) CMV, 22’sinin (% 9) PRSV, 6’sının (% 2, 5) SqMV, 20’sinin (8, 5) CGMMV ile enfekteli olduğu bulunmuştur. DAS-ELISA testleri sonunda Ankara ve Antalya illerinde en yaygın virüsler WMV ve ZYMV olarak belirlenmiştir. Çalışmada ilk defa sakız kabağı ve bal kabağı bitkilerinde CGMMV etmeninin varlığı serolojik olarak tespit edilmiştir. Test sonunda ZYMV ile enfekteli bitkiler seçilmiş ve Konya, Karaman ve Aksaray illerinden toplanan farklı kabakgillerden izole edilen ZYMV izolatları ile birlikte moleküler olarak, P1 protein, yardımcı bileşen protein (HC-Pro), P3 protein, silindirik inclusion protein (CI), Nüklear inclusion protein b (NIb) ve örtü proteini (CP) gen bölgelerinin baz dizilimi belirlenmiş ve MEGA 6 bilgisayar programı kullanılarak filogenetik ve protein analizi yapılmıştır. Çalışmada 53 izolatın gen bölgelerinin sekans verileri NCBI veri bankasında yer alan sekanslarla karşılaştırılmış ve 50 tane ZYMV Türkiye izolatı Dünya’da ve Avrupa’da en yaygın olan A1 grubunda yer alırken üç tane ZYMV Türkiye … |
| Anahtar Kelimeler |
